MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY04

Total Repeats: 771

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009470	CAT	2	6	23863	23868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244076
502	NC_009470	CAAC	2	8	23877	23884	50 %	0 %	0 %	50 %	148244076
503	NC_009470	CAG	2	6	23989	23994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244076
504	NC_009470	ACC	2	6	24065	24070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244076
505	NC_009470	CAA	2	6	24091	24096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244076
506	NC_009470	CCG	2	6	24218	24223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
507	NC_009470	TG	3	6	24224	24229	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
508	NC_009470	CGG	2	6	24243	24248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_009470	ACGC	2	8	24324	24331	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
510	NC_009470	AAG	2	6	24340	24345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_009470	ATG	2	6	24356	24361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244077
512	NC_009470	GCA	2	6	24394	24399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244077
513	NC_009470	CATG	2	8	24401	24408	25 %	25 %	25 %	25 %	148244077
514	NC_009470	GCCT	2	8	24416	24423	0 %	25 %	25 %	50 %	148244077
515	NC_009470	GCA	2	6	24449	24454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244077
516	NC_009470	GGCCA	2	10	24640	24649	20 %	0 %	40 %	40 %	148244077
517	NC_009470	CGAT	2	8	24708	24715	25 %	25 %	25 %	25 %	148244077
518	NC_009470	GCA	2	6	24992	24997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244077
519	NC_009470	GCC	2	6	25011	25016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244077
520	NC_009470	AAG	2	6	25040	25045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244077
521	NC_009470	GC	3	6	25073	25078	0 %	0 %	50 %	50 %	148244077
522	NC_009470	GCC	2	6	25104	25109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244077
523	NC_009470	CCGC	2	8	25137	25144	0 %	0 %	25 %	75 %	148244077
524	NC_009470	GC	3	6	25216	25221	0 %	0 %	50 %	50 %	148244077
525	NC_009470	GGGCC	2	10	25306	25315	0 %	0 %	60 %	40 %	148244077
526	NC_009470	GCTG	2	8	25355	25362	0 %	25 %	50 %	25 %	148244077
527	NC_009470	CCGGG	2	10	25465	25474	0 %	0 %	60 %	40 %	148244077
528	NC_009470	G	6	6	25483	25488	0 %	0 %	100 %	0 %	148244077
529	NC_009470	CCGG	2	8	25565	25572	0 %	0 %	50 %	50 %	148244077
530	NC_009470	CTA	2	6	25608	25613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244077
531	NC_009470	CATAT	2	10	25654	25663	40 %	40 %	0 %	20 %	148244077
532	NC_009470	CAT	2	6	25772	25777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_009470	TCACCG	2	12	25784	25795	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
534	NC_009470	GCC	2	6	25846	25851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
535	NC_009470	CGG	2	6	25897	25902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_009470	GCG	2	6	25926	25931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244078
537	NC_009470	GCC	2	6	25973	25978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244078
538	NC_009470	AGC	2	6	25979	25984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244078
539	NC_009470	GAT	2	6	25985	25990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244078
540	NC_009470	GCC	2	6	26022	26027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244078
541	NC_009470	GCC	2	6	26037	26042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244078
542	NC_009470	CTC	2	6	26075	26080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244078
543	NC_009470	TTGC	2	8	26166	26173	0 %	50 %	25 %	25 %	148244078
544	NC_009470	CAT	2	6	26174	26179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244078
545	NC_009470	GTGAA	2	10	26198	26207	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
546	NC_009470	GCC	2	6	26249	26254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_009470	ATGA	2	8	26347	26354	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
548	NC_009470	CAAT	2	8	26365	26372	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
549	NC_009470	T	6	6	26390	26395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_009470	CCGG	2	8	26494	26501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
551	NC_009470	TTC	2	6	26632	26637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148244079
552	NC_009470	AATC	2	8	26648	26655	50 %	25 %	0 %	25 %	148244079
553	NC_009470	CGG	2	6	26706	26711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244079
554	NC_009470	C	6	6	26716	26721	0 %	0 %	0 %	100 %	148244079
555	NC_009470	ACA	2	6	26770	26775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244079
556	NC_009470	CG	3	6	26820	26825	0 %	0 %	50 %	50 %	148244079
557	NC_009470	ATA	2	6	26883	26888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	148244079
558	NC_009470	GCA	2	6	26936	26941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244079
559	NC_009470	CTC	2	6	26958	26963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244079
560	NC_009470	CAA	2	6	26969	26974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148244079
561	NC_009470	GCG	2	6	27063	27068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244079
562	NC_009470	CTC	2	6	27072	27077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244079
563	NC_009470	AGC	2	6	27091	27096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244079
564	NC_009470	CCA	2	6	27246	27251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244080
565	NC_009470	GCCG	2	8	27293	27300	0 %	0 %	50 %	50 %	148244080
566	NC_009470	CGC	2	6	27325	27330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244080
567	NC_009470	CCG	2	6	27405	27410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244080
568	NC_009470	GCA	2	6	27501	27506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244080
569	NC_009470	GCAGG	2	10	27522	27531	20 %	0 %	60 %	20 %	148244080
570	NC_009470	C	8	8	27538	27545	0 %	0 %	0 %	100 %	148244080
571	NC_009470	CGA	2	6	27562	27567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148244080
572	NC_009470	CGGT	2	8	27591	27598	0 %	25 %	50 %	25 %	148244080
573	NC_009470	ACT	2	6	27622	27627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244080
574	NC_009470	TGG	2	6	27686	27691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148244080
575	NC_009470	CGC	2	6	27746	27751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244080
576	NC_009470	TC	3	6	27835	27840	0 %	50 %	0 %	50 %	148244080
577	NC_009470	GC	3	6	27868	27873	0 %	0 %	50 %	50 %	148244080
578	NC_009470	CTC	2	6	27874	27879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148244080
579	NC_009470	CCG	2	6	27921	27926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244080
580	NC_009470	CCG	2	6	27967	27972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244080
581	NC_009470	CCGC	2	8	27999	28006	0 %	0 %	25 %	75 %	148244080
582	NC_009470	GAT	2	6	28078	28083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244080
583	NC_009470	CCGC	2	8	28084	28091	0 %	0 %	25 %	75 %	148244080
584	NC_009470	CGC	2	6	28100	28105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244080
585	NC_009470	CAC	2	6	28138	28143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244080
586	NC_009470	CTG	2	6	28210	28215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244080
587	NC_009470	ACC	2	6	28235	28240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244080
588	NC_009470	CAC	2	6	28303	28308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	148244080
589	NC_009470	CGG	2	6	28312	28317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244080
590	NC_009470	GCC	3	9	28334	28342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244080
591	NC_009470	GCC	2	6	28349	28354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148244080
592	NC_009470	C	6	6	28369	28374	0 %	0 %	0 %	100 %	148244080
593	NC_009470	GTCCG	2	10	28409	28418	0 %	20 %	40 %	40 %	148244080
594	NC_009470	TCC	2	6	28515	28520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_009470	CAG	2	6	28557	28562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_009470	GAA	2	6	28612	28617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
597	NC_009470	GCCC	2	8	28666	28673	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
598	NC_009470	TCT	2	6	28702	28707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_009470	CT	3	6	28773	28778	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
600	NC_009470	CAA	2	6	28789	28794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_009470	CCA	2	6	28798	28803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_009470	CGA	3	9	28819	28827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_009470	CCG	2	6	28839	28844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_009470	GAC	2	6	28852	28857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_009470	CG	3	6	28865	28870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
606	NC_009470	T	6	6	29007	29012	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_009470	CGC	2	6	29135	29140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_009470	TGAT	2	8	29144	29151	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
609	NC_009470	ACCG	2	8	29160	29167	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
610	NC_009470	GA	3	6	29172	29177	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
611	NC_009470	CTA	2	6	29197	29202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_009470	CTA	2	6	29247	29252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_009470	TCTG	2	8	29293	29300	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
614	NC_009470	CATG	2	8	29306	29313	25 %	25 %	25 %	25 %	148244081
615	NC_009470	AGG	2	6	29340	29345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148244081
616	NC_009470	ATC	2	6	29413	29418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148244081
617	NC_009470	GAT	2	6	29491	29496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148244081
618	NC_009470	GC	3	6	29541	29546	0 %	0 %	50 %	50 %	148244081
619	NC_009470	GGC	2	6	29667	29672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148244081
620	NC_009470	AAG	3	9	29693	29701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	148244081
621	NC_009470	CTG	2	6	29720	29725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148244081
622	NC_009470	AG	3	6	29944	29949	50 %	0 %	50 %	0 %	148244081
623	NC_009470	CTT	2	6	29959	29964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148244081
624	NC_009470	GAG	2	6	29977	29982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148244081
625	NC_009470	CCG	2	6	30027	30032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
626	NC_009470	CGC	2	6	30086	30091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_009470	CAG	2	6	30104	30109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_009470	CCA	2	6	30178	30183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
629	NC_009470	GAC	2	6	30184	30189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_009470	TACCG	2	10	30201	30210	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
631	NC_009470	CCG	2	6	30250	30255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_009470	TGC	2	6	30320	30325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_009470	ATG	2	6	30384	30389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
634	NC_009470	CCG	2	6	30403	30408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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763	NC_009470	TCG	2	6	37041	37046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
764	NC_009470	GCGT	2	8	37059	37066	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
765	NC_009470	ACGG	2	8	37070	37077	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
766	NC_009470	ACA	2	6	37122	37127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
767	NC_009470	CAG	2	6	37128	37133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
768	NC_009470	CGG	2	6	37223	37228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
769	NC_009470	GGC	2	6	37248	37253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
770	NC_009470	TGACG	2	10	37276	37285	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
771	NC_009470	GTC	2	6	37389	37394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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